Так, как головной мозг можно назвать главным органом всего организма, так гипоталамус можно назвать маленьким мозгом большой нейроэндокринной системы.
Огромная сеть нервных путей, которыми гипоталамус связан абсолютно со всеми отделами нервной системы, позволяет ему контролировать работу всей эндокринной системы, регулируя выработку гормонов в реальном времени.
Помимо управления другими железами, сам гипоталамус выделяет гормоны, которые регулируют развитие половой системы, определяют циркадные ритмы сна, управляют ощущениями голода и жажды.